Python 在 conda 环境中在 MacOS 上的 R 中导入库时如何解释和修复未找到共享对象错误

我正在try 从CONDA环境中的特定R路径导入R包，但一直收到以下错误:

Error: package or namespace load failed for ‘marginaleffects’ in library.dynam(lib, package, package.lib):
shared object ‘data_table.so’ not found

我不仅在努力理解如何修复这个错误，而且还在努力理解这个错误意味着什么，或者它来自哪里.

具体地说，我正在使用基于Pythonstreamlit框架部署一个Web应用程序，并使用包rpy2从现有的R代码库连接到Python.我使用conda/manba作为我机器上的包管理器.我已经尽可能使用它们的Conda-Forge发行版安装了所有的R包.有几个R包不可用，因此我使用:install.packages("marginaleffects", dep = TRUE, lib = "/Users/myuser/mambaforge/envs/myenv/lib/R/library", verbose = TRUE)将它们安装在我所需的库路径的R中.然后，该包看起来存在于目录.../myenv/lib/R/library、installed.packages()中以及RStudio的包列表中.

然而，当我try 加载带有library(marginaleffects, lib.loc="/Users/myuser/mambaforge/envs/myenv/lib/R/library")的包时，我收到了上面提到的错误.请注意，如果我在Streamlight应用程序中运行的R代码中导入此包，则会引发与.dylib共享对象有关的略微不同的错误，而不是与‘.so’共享对象相关的错误.

RRuntimeError: Error: package or namespace load failed for ‘marginaleffects’ in library.dynam(lib, package, package.lib): shared object ‘marginaleffects.dylib’ not found

我有一种最模糊的感觉，这与一个编译器错误有关.我也没有成功地通过rpy2框架安装包，收到了一条冗长且相当费解的错误消息.

EDIT个

到目前为止，我在MacOS(Ventura，在Big Sur上发生了相同的问题)上运行的代码可重现性:

zsh> mamba create -n myenv r-essentials r-base python=3.8
zsh> mamba activate myenv
zsh> mamba install -c r rpy2 
zsh> mamba install -c conda-forge pandas
zsh> mamba install -c conda-forge streamlit

R> install.packages("clarify", dep = TRUE, lib = "/Users/myname/mambaforge/envs/myenv/lib/R/library", verbose = TRUE)
R> install.packages("marginaleffects", dep = TRUE, lib = "/Users/myname/mambaforge/envs/myenv/lib/R/library", verbose = TRUE)
R> library(marginaleffects, lib.loc="/Users/myuser/mambaforge/envs/myenv/lib/R/library")

Error: package or namespace load failed for ‘marginaleffects’ in library.dynam(lib, package, package.lib):
shared object ‘data_table.so’ not found

EDIT2个

我正在运行OSX-64.