我如何编写代码以搜索组内的多个列 R

发布于05月24日

我有癌症数据，每个病人都做了1-4次测量.有些测量做了细胞学判断，有些做了病理学判断，有些两者都做了.

library(dplyr)
library(tibble)

data<-tribble(
  ~record_number, ~tool, ~cytology, ~pathology,
  114, "forceps", "Indeterminate", NA,
  114, "needle", "Non-Malignant", "Malignant",
  114, "lavage", NA, "Indeterminate",
  115, "forceps", NA, "Non-Malignant",
  115, "needle", NA, "Malignant"
)

如果给定主题(RECORD_NUMBER)的either列(细胞学、病理学)中的任何样本(行)出现"恶性"，我想创建一个恶性变量(0/1).

任何 idea 都很受欢迎！

desired<-tribble(
  ~record_number, ~tool, ~cytology, ~pathology, ~ Malignant,
  114, "forceps", "Indeterminate", NA, 1,
  114, "needle", "Non-Malignant", "Malignant", 1,
  114, "lavage", NA, "Indeterminate", 1, 
  115, "forceps", NA, "Non-Malignant", 1, 
  115, "needle", NA, "Malignant", 1,
)

我想它将以GROUP_BY(RECORD_NUMBER)开始……但是然后呢？

desired<-data %>%
  group_by(record_number) %>%
  ...?

library(dplyr) #> 1.1.0 data %>% mutate(Malignant = ifelse(any(cytology == "Malignant" | pathology == "Malignant", na.rm = TRUE), 1, 0), .by=record_number) record_number tool cytology pathology Malignant <dbl> <chr> <chr> <chr> <dbl> 1 114 forceps Indeterminate NA 1 2 114 needle Non-Malignant Malignant 1 3 114 lavage NA Indeterminate 1 4 115 forceps NA Non-Malignant 1 5 115 needle NA Malignant 1

我如何编写代码以搜索组内的多个列 R

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