在bash中将数组作为Java程序的参数传递

发布于02月28日

我正在通过bash脚本运行一个Java程序. 我的计划是迭代for循环以创建要传递的参数:

lastLine=$(cat $info_file | wc -l)

countID=0

cat $info_file | while read fileID; do

initVar="${initVar} ${fileID}.txt"

countID=$(($countID + 1))

if [ "$countID" == "$lastLine" ]; then
echo $initVar > tmp_${SampleID}.txt
fi

done

InputListVar=$(cat tmp_${SampleID}.txt)

java ProgramX --input "${InputListVar[@]}" --output $output_file

但是，当我运行上面的脚本时，我收到以下消息:

Exception in thread "main" java.lang.IllegalArgumentException: Illegal character in path at index 15

我认为这是由于我在InputListVar数组中提供的文件列表中的空间(如这里建议的Illegal character in path at index 16).我怎么才能解决这个问题呢？

推荐答案

我不与java打交道，但我想java会希望看到这样的情况:

java --input file1 file2 file3 --output ...

OP的脚本应该生成这样的格式:IF InputListVar被定义为数组，但它不是.下面创建一个标量变量:

InputListVar=$(cat tmp_${SampleID}.txt)

如果我们假设输入文件的以下内容:

$ cat tmp_${SampleID}.txt
file1
file2
file3

然后，我们得到以下内容:

$ InputListVar=$(cat tmp_${SampleID}.txt)
$ typeset -p InputListVar
declare -- InputListVar=$'file1\nfile2\nfile3'

因此，当它被馈送到java时，会发生以下情况:

java --input "${InputListVar[@]}" --output ...

# becomes

java -- input file1
file2
file3 -- ouput ...

# hence an error

NOTE: ${InputListVar}在技术上与${InputListVar[0]}相同，因此OP的${InputListVar[@]}变为${InputListVar[0]}，变为${InputList}

我们可以通过确保使用的是一个数组来"修复"这个问题:

InputListVar=( $(cat tmp_${SampleID}.txt) )           # note the additional pair of outer parens

回到java电话:

java --input "${InputListVar[@]}" --output ...

# becomes

java -- input file1 file2 file3 -- ouput ...

在bash中将数组作为Java程序的参数传递

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